54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1899 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  339  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  67.24 
 
 		 193 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  71.01 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  35.09 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  37.16 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  33.92 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  33.92 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  33.53 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  30.05 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  36.5 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  33.17 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  40.15 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  32.14 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  34.46 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  35.21 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  33.9 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  31.74 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  33.09 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  34.85 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  35.66 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  34.85 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  35.25 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  35.25 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  31.43 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  31.88 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  30.3 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  34.85 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  32.02 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 386 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  35.34 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  31.69 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  30.95 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  32.14 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  27.22 
 
 		 219 aa  52  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  32.28 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.59 
 
 		 241 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  32.43 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  31.16 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  32.09 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.92 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  33.82 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.11 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  28.26 
 
 		 254 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.08 
 
 		 228 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  35.62 
 
 		 238 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13471  hypothetical protein  27.45 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.17 
 
 		 554 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  38.14 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>