233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1458 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  100 
 
 		 211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  46.83 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  50.26 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  42.72 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0158  Rhomboid family protein  46.5 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1636  Rhomboid family protein  32.57 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  29.94 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  38.66 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  38.66 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  34.93 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  25.37 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  33.1 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.97 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.34 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  32.62 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  36.62 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  29.29 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  31.41 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  32.41 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.15 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.15 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  28.7 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.89 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  32 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  33.68 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  26.74 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  32.68 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  32.58 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  29.72 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  35.63 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  27.23 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  37.38 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  28.87 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  28.87 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  27.23 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  28.87 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  36.14 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30.49 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  27.23 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  27.23 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  27.8 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  27.23 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  28.17 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.02 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30 
 
 		 303 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  27.41 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  28.17 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 360 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  29.25 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 360 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.16 
 
 		 547 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 		 625 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 389 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  39.56 
 
 		 256 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  31.25 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 289 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.12 
 
 		 625 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  34.12 
 
 		 625 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.12 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  34.69 
 
 		 319 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  27.33 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  30.16 
 
 		 541 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  27.17 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  34.34 
 
 		 292 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  34.5 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  29.05 
 
 		 286 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 172 aa  51.6  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  25.32 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  29.37 
 
 		 541 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  33.65 
 
 		 266 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 486 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  37.8 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  30.14 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  34.31 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  38.75 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  38.27 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  29.32 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  34.88 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  37.8 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  36.59 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  29.31 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  36.25 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  27.69 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  32.09 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 528 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>