More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1128 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  100 
 
 		 319 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  73.65 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  57.32 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  53.27 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  49.32 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  29.97 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  36 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  37.31 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  34.73 
 
 		 205 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.77 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.02 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  34.38 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.11 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  29.94 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  34.01 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  30.29 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  35.9 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  32.9 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  32.32 
 
 		 197 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.16 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.61 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  29.91 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  25 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  33 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  29.44 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.22 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  33.72 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  32.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  29.9 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  27.96 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  26.54 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  29.21 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.89 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  30.06 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  27.98 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  29.85 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  36.52 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  31.82 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  31.82 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  26.86 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  31.18 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  33.13 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  30.52 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  34.82 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  30.1 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  32.45 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  32.69 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  61.54 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35318  predicted protein  31.85 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  26.69 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30.86 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  27.01 
 
 		 241 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 547 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  30.14 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  28.88 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  25.36 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  31.82 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  31.41 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  33.11 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  25.47 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  25.47 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  27.2 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  38.68 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  53.85 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  28.48 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2202  hypothetical protein  25.09 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  29.71 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  30.49 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  29.75 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4170  Rhomboid family protein  30.36 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.303634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  30.23 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  29.24 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  32.37 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  35.51 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  29.86 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  31.01 
 
 		 202 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  30.99 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  25.4 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 246 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  28.85 
 
 		 200 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  28.86 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>