22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35318 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35318  predicted protein  100 
 
 		 327 aa  655    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  30.29 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  28.22 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  28.48 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  36.78 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.96 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  30.87 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  26.26 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  26.95 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  26.95 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  29.73 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  28.29 
 
 		 209 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  26.45 
 
 		 226 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  30 
 
 		 160 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  31.41 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  29.89 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  29.53 
 
 		 234 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  28.87 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  26.11 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  26.02 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>