194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_6645 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  100 
 
 		 325 aa  655    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  37.23 
 
 		 571 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  33.54 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  32.57 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  29.79 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  35.22 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  34.52 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  32.88 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  31.53 
 
 		 220 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  30.93 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  33.65 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  30.97 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.56 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.14 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  31.85 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  34.48 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  27.16 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  33.11 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  27.73 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  27.73 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  30.37 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04190  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.58642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35318  predicted protein  30.29 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  27.22 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.66 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.1 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  32.3 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  25.81 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  24.54 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  30.26 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.19 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  32.62 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  28.7 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  28 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  29.67 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  30.82 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  27.48 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  32.39 
 
 		 160 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  25.47 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  25.25 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  28.64 
 
 		 209 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  34.58 
 
 		 197 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  27.98 
 
 		 237 aa  53.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  34.46 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  27.64 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 252 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  26.85 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  26.11 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  32.41 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  37.35 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  28.48 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  28.48 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  27.06 
 
 		 569 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  28.48 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.19 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  30.18 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  27.35 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.43 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  27.44 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.1 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  31.69 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  28.82 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  31.13 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 227 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  30.96 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.9 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  31.09 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  27.11 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.54 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  27.67 
 
 		 231 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  24.73 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  29.69 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  28.48 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  28.48 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  28.48 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 200 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  28.48 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  27.37 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>