206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1387 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  99.01 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  74.75 
 
 		 202 aa  318  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  69.5 
 
 		 208 aa  300  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  50 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  50.28 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  51.83 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  51.31 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  46.03 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  46.28 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  44.95 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  47.34 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  42.62 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  34.54 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  36.13 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  34.05 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  34.39 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  34.39 
 
 		 280 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  33.51 
 
 		 279 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  35.71 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  34.42 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  36.5 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  37.06 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  34.03 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.78 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  35 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  35.42 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.57 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.11 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  33.81 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  36.81 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  36.81 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  31.16 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  36.55 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  31.06 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  36.55 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  36.55 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  36.55 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  36.55 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  31.55 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.37 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  28.77 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  32.72 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  35.61 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  34.18 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  28.89 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  34.06 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  30.37 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  36.27 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.03 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  38.39 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  31.58 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  29.38 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.43 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 492 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  34.55 
 
 		 356 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.29 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  30.41 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  35.1 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  29.7 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  25.63 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  30.64 
 
 		 296 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 278 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  31.76 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.87 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  31.29 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  29.01 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  32.09 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  29.17 
 
 		 579 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  28.87 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  38.3 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  30.69 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  29.8 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  29.11 
 
 		 504 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  31.4 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  32.82 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.66 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  36.52 
 
 		 324 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  27.37 
 
 		 325 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  32.29 
 
 		 274 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  27.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  29.27 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  26.54 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  28.47 
 
 		 288 aa  48.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  26.4 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 264 aa  48.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  40 
 
 		 306 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  32.03 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>