238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1836 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  40.59 
 
 		 212 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  46.32 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  42.93 
 
 		 280 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  41.71 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  36.13 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  38.89 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  36.13 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  34.76 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  39.33 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  34.01 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  37.89 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  37.58 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  33.15 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  35.03 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  35.03 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.93 
 
 		 554 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  31.51 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.15 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  32.19 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.73 
 
 		 579 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  38.04 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  31.97 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.85 
 
 		 444 aa  61.6  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  32.99 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  36.96 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  34.75 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  39.33 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  36.22 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  33.95 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  38.54 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  33.33 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 487 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.34 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  36.22 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  28.67 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  29.95 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  35.96 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  30.16 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  28.39 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  25.29 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  28.27 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  34.69 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  32.39 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  30.56 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.94 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  27.8 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  42.22 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  28.97 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  28.72 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  37.25 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  33.57 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  27.63 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  26.77 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  35.8 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32.85 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.86 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 396 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.3 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.16 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  43.37 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  26.8 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  29.29 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  43.37 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  34.44 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  29.86 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  29.86 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  29.86 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  27.63 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.43 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  29.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  29.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.86 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 298 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  29.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  29.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  29.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  43.37 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 278 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  31.63 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  28.08 
 
 		 252 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>