200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0312 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  69.52 
 
 		 230 aa  281  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  69.52 
 
 		 202 aa  280  9e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  53.57 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  47.47 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  45 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  45 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  46.5 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  42.5 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  46.74 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  40.98 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  46.37 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  40.72 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  41.4 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  40.91 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  28.35 
 
 		 280 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  32.68 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  32.46 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  34.25 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  32.5 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  35.04 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  34.69 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.97 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  36.49 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  36.49 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  36.49 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  36.73 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.75 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  36.73 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  36.73 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  36.73 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  31.11 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.4 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.47 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.41 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.25 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  28.02 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  29.26 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  28.67 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  27.32 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.15 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  30.38 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  35.63 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  28.78 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  36.73 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  28.19 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  31.61 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.62 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35.09 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.62 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 302 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  33.62 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  30.05 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.11 
 
 		 554 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  36.46 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  29.79 
 
 		 492 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  34 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.77 
 
 		 486 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  34.53 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  33.61 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  34.53 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  28.07 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  37.63 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 487 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 487 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  37.63 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  38.24 
 
 		 489 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  30.07 
 
 		 523 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  27.5 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  31.29 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.78 
 
 		 389 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  39.06 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  30.53 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 342 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  38.64 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  28.77 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>