203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0305 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  100 
 
 		 230 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  99.01 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  69.52 
 
 		 206 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  50 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  51.52 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  52.5 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  50 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  48.37 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  42 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  44.02 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  46.28 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  37.76 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  37.7 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  38.33 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  39.44 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  34.41 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  30.5 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  32.18 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  32.86 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  35.86 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  28.71 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  33.76 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.36 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  33.96 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  34.31 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  30.68 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  34.43 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  33.79 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  34.48 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  30.16 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  35.86 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  35.86 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  35.86 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  35.86 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  35.86 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  35.86 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  35.86 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  32.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.03 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  29.01 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  33.58 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  30.34 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  29.5 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 523 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  34.31 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  30.72 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31.94 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.6 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.6 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.6 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  29.27 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.87 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  28.06 
 
 		 496 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  30.34 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  26.58 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  37.35 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  29.19 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  37.62 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  29.57 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  31.45 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  29.05 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  25.54 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  30.47 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.89 
 
 		 486 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  28.65 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  32.38 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.2 
 
 		 541 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  29.93 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  30 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  33.68 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 348 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  28.66 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  25.6 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 396 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.41 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  31.48 
 
 		 285 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>