More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0917 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  100 
 
 		 177 aa  346  8e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  52.3 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  55.76 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  55.76 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  53.94 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  55.56 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  57.66 
 
 		 176 aa  154  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  42.16 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  35.06 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  32.24 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.16 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  38.17 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  31.84 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  35.46 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  34.73 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  38.06 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  38.04 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  35.46 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  31.44 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  37.36 
 
 		 358 aa  64.3  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  35.62 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  40.23 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  34.54 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  34.54 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  39.34 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  31.01 
 
 		 569 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  37.74 
 
 		 247 aa  62  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.82 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  39.81 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  34.82 
 
 		 444 aa  62  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.28 
 
 		 396 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 		 625 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  40 
 
 		 523 aa  61.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  29.69 
 
 		 625 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.69 
 
 		 625 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.71 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  32.52 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  30.65 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  42.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  28.51 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  40.23 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.37 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.35 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  40 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  41.11 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  36.43 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  40.86 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  40 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  33.97 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  27.34 
 
 		 625 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  39.08 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  33.16 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  39.78 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  30.07 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  31.87 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  32.62 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  29.89 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  30.92 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  38.64 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  36.05 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  42.17 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  30.69 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  31.17 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  28.24 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  30.58 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  28.12 
 
 		 625 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  34.92 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.59 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.59 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  37.5 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  30.92 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  33.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.59 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  37.39 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  35.71 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  27.91 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  37.86 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.81 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  29.53 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.73 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  32.89 
 
 		 273 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  30.67 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  34.67 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.59 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  43.75 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>