164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5567 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  58.44 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  46.53 
 
 		 290 aa  272  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  40 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  37.34 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  37.07 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  33.44 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  33.01 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  32.13 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  33.45 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  32.37 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.88 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  31.19 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.06 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.77 
 
 		 276 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  27.21 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  27.65 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.16 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  30.71 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  29.19 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  33.15 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.19 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  26.27 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  29.95 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  32.12 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  26 
 
 		 209 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.89 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  25.6 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  30.46 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  27.15 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  28.4 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  30 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  26.24 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  35.46 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  26.79 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  31.25 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  26.79 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  25.85 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  27.52 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  27.22 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  31.21 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  27.75 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  31.45 
 
 		 190 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  29.09 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.76 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  28.98 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  26.12 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  27.88 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 226 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  27.5 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  24.15 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  34.75 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  34.75 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.06 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1812  hypothetical protein  25.32 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.515033  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  30.52 
 
 		 202 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  34.75 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 202 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  28.43 
 
 		 218 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  24.61 
 
 		 259 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  31.09 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  23.96 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  30.56 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  34.75 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  28.19 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  34.75 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  34.75 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  34.75 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  26.7 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  29.68 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  27.95 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  28 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  26.59 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.46 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  32.26 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  27.7 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  35.23 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.4 
 
 		 486 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1551  rhomboid-like protein  31.03 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  31.37 
 
 		 492 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  25.81 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  27.04 
 
 		 554 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  23.05 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  29.45 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  26.59 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  27.45 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  28.31 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>