270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2070 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  100 
 
 		 224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  47.89 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  37.88 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  46.26 
 
 		 281 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  46.85 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  43.24 
 
 		 290 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  44.06 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  38.81 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  44.68 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  46.27 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  46.27 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  45.14 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  46.27 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  47.76 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  46.27 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  47.76 
 
 		 280 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  44.1 
 
 		 292 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  47.76 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  45.45 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  43.26 
 
 		 289 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  40.11 
 
 		 286 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  37.44 
 
 		 286 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  43.36 
 
 		 279 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 295 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  44.78 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  44.12 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  36.18 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  36.11 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  37.16 
 
 		 295 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  45.65 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  45.59 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  36.74 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  42.55 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  42.47 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  41.91 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  39.73 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  39.73 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  39.73 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  39.73 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  39.73 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  44.03 
 
 		 295 aa  99.4  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  41.18 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  41.18 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  39.04 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  39.04 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  41.91 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  39.04 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  41.18 
 
 		 259 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  39.04 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  39.04 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  39.04 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  39.04 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  39.04 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  39.04 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  40.44 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 340 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  40.44 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  39.71 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  41.18 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  35.82 
 
 		 293 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  39.71 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  33.19 
 
 		 287 aa  91.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  40.56 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35.51 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.85 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  35.62 
 
 		 381 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.56 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  27.41 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.75 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.97 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  29.25 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  31.37 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  29.63 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  35.21 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  25.52 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.19 
 
 		 554 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  31.58 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  30.16 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  30.72 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  30.54 
 
 		 275 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4634  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.248838  normal  0.0634854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  25.52 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  30.29 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.73 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  31.61 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  32.91 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.38 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  26.39 
 
 		 386 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  35.19 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  25.12 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  31.11 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  29.14 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>