137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00069 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  100 
 
 		 287 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  52.65 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  44.09 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  39.39 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  37.31 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  37.31 
 
 		 278 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  40.91 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  39.02 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  39.02 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  38.26 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  36.2 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  38.64 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  37.22 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  37.68 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  36.76 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  38.49 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  38.49 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  36.26 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  36.47 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  36.47 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  38.32 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  36.47 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  40.96 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  36.56 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  38.57 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  35.99 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  35.21 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  37.64 
 
 		 276 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  34.36 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  33.92 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  33.92 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  34.36 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  34.02 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  34.02 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  34.02 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  34.02 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  34.02 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  34.02 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  34.02 
 
 		 276 aa  149  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  33.92 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  33.92 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  33.92 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  33.94 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  31.62 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  33.7 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  34.66 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  33.48 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  29.97 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  33.66 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  32.38 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  30.04 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  31.09 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  37.35 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  28.63 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  39.1 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  30.99 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  32.22 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  35.76 
 
 		 224 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  32.51 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  27.5 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  29.05 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  24.21 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  32.68 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  30.07 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  27.63 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.5 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  29.11 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  27.12 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  27.12 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  25.85 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  28.68 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  29.41 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  29.41 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  28.68 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 513 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  27.21 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  24.7 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  29.81 
 
 		 190 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  34.52 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.57 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  28.47 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  35.37 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  31.25 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  26.45 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.71 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  25 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  27.52 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  30.98 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  29.08 
 
 		 365 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  40 
 
 		 556 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  24.46 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  24.46 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>