151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0312 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  77.01 
 
 		 280 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  67.4 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  67.52 
 
 		 277 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  62.59 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  61.09 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  61.09 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  57.45 
 
 		 276 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  57.45 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  57.09 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  57.82 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  57.82 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  57.82 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  58.09 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  58.09 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  55.64 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  60.16 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  42.81 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  42.81 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  41.64 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  42.34 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  41.67 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  39.93 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  39.43 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  39.93 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  39.71 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  40.29 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  40.29 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  39.93 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  37.77 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  37.63 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  40.86 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  38.32 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  36.86 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  36.5 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  36.67 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  35.93 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  34.93 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  33.94 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  31.34 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  32.93 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  34.07 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  30.29 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  32.33 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  33.72 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  39.71 
 
 		 224 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  31.7 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  42.96 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  45.93 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  27.65 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  32.23 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  35.64 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  26.96 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  32.05 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  35 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.77 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  25.93 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  26.38 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  26.38 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  24.82 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  26.94 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.03 
 
 		 519 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  28.1 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.42 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  30.91 
 
 		 444 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  29.02 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  29.7 
 
 		 389 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  24.82 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  27.53 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  30.66 
 
 		 513 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  25.5 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.25 
 
 		 207 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  30 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  30.58 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  26.32 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  28.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.5 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  30.08 
 
 		 386 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  27.33 
 
 		 362 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  21.3 
 
 		 511 aa  48.9  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  30.59 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  28.19 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  22.63 
 
 		 487 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  27.18 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>