161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0230 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  77.01 
 
 
274 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  66.42 
 
 
277 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  66.18 
 
 
277 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  61.68 
 
 
278 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  60.58 
 
 
278 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  60.58 
 
 
278 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  60 
 
 
259 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  55.96 
 
 
276 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  55.96 
 
 
276 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  55.96 
 
 
276 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  55.23 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  56.2 
 
 
274 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  56.2 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  54.87 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  54.87 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  54.87 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  54.87 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  54.87 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  54.87 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  54.87 
 
 
276 aa  305  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  54.51 
 
 
276 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  54.51 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  43.54 
 
 
277 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  42.75 
 
 
280 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  43.43 
 
 
280 aa  221  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  39.35 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  42.39 
 
 
280 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  39.21 
 
 
280 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  39.07 
 
 
280 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  39.07 
 
 
280 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  40.58 
 
 
279 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  38.99 
 
 
280 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  38.38 
 
 
276 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  37.05 
 
 
281 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  37.77 
 
 
278 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  36.92 
 
 
281 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  36.69 
 
 
281 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  36.92 
 
 
281 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  37.77 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  36.2 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  36.56 
 
 
278 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  38.21 
 
 
278 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  37.86 
 
 
280 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  36.43 
 
 
292 aa  168  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  34.31 
 
 
295 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  33.7 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  32.63 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  32.81 
 
 
285 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  42.18 
 
 
290 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  40.56 
 
 
224 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  30.63 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  31.1 
 
 
289 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  26.46 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  32.96 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  30.86 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  42.96 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  30.6 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  32.8 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  39.73 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  30.4 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  39.42 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  29.9 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  29.72 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  27 
 
 
389 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.64 
 
 
358 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  31.71 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.98 
 
 
486 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  31.71 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.12 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  25.55 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  31 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  25.91 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  25.91 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  28.5 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  24.82 
 
 
342 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  33.08 
 
 
386 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  28.93 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35.11 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  34.35 
 
 
318 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  30.05 
 
 
376 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.94 
 
 
554 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  27.52 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.93 
 
 
371 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  29.29 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  29.29 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.16 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  29.7 
 
 
348 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  24.35 
 
 
205 aa  52.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  26.12 
 
 
360 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.87 
 
 
284 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  30.09 
 
 
444 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  27.97 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  25.4 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  25.64 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  30.6 
 
 
519 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.05 
 
 
511 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  36.46 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  30.88 
 
 
569 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.113999 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>