179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3467 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  100 
 
 		 280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  47.46 
 
 		 280 aa  244  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  44.6 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  42.65 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  42.81 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  41.39 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  41.37 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  41.22 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  41.3 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  41.01 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  41.67 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  40.58 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  40.58 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  40.58 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  40.58 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  41.22 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  41.01 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  42.91 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  39.85 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  38.17 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  38.93 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  38.79 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  35.38 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  35.27 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  40.07 
 
 		 280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  37.18 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  37.18 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  35.38 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  35.38 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  39.49 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  37.18 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  38.15 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  36.82 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  38.15 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  35.27 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  37.64 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  36.67 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  36.2 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  38.63 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  37.28 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  37.85 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  37.86 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  30.25 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  44.06 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  33.8 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  44.68 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  41.96 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  40.29 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  41.35 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  44.3 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  34.94 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  42.66 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  43.62 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  40.56 
 
 		 290 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  46.46 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  37.34 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  42.66 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  43.31 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  29.32 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  25.73 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  26.82 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.09 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  26.26 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  28.96 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  30.08 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.09 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  29.29 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.56 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  29.8 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  31.47 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  31.76 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  28.8 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  29.11 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  31.62 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  28.96 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  29.93 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  23.72 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  32.68 
 
 		 556 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.07 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.29 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 487 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 487 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  21.51 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  29.71 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  27.59 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  29.23 
 
 		 511 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  29.93 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>