227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1309 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  36.77 
 
 
292 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  34.64 
 
 
289 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  33.9 
 
 
295 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  34.66 
 
 
286 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  34.02 
 
 
295 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  33.56 
 
 
295 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  33.22 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  34.09 
 
 
286 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  35.71 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  32.4 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  37.36 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  31.29 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  34.7 
 
 
280 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  34.33 
 
 
280 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  35.17 
 
 
281 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  33.22 
 
 
290 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  33.8 
 
 
283 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  34.33 
 
 
280 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  35.29 
 
 
280 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  34.75 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  47.89 
 
 
224 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  34.32 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  33.9 
 
 
281 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  31.71 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  31.14 
 
 
259 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  31.14 
 
 
278 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  31.14 
 
 
278 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  38.3 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  31.42 
 
 
278 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  33.33 
 
 
276 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  32.3 
 
 
278 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  34.43 
 
 
281 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  32.93 
 
 
274 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  29.76 
 
 
278 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  32.94 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  32.94 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  32.94 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  32.94 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  32.94 
 
 
276 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
276 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
276 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  32.81 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  32.26 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  32.13 
 
 
277 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  37.37 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  31.69 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  31.41 
 
 
280 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  31.68 
 
 
280 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  36.87 
 
 
295 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  32.55 
 
 
280 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  39.86 
 
 
293 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  34.41 
 
 
292 aa  99  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  28.52 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  35.03 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
340 aa  95.5  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  28.1 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  27.04 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  34.72 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  31.94 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  29.72 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.19 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  33.09 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30.59 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.99 
 
 
358 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30.88 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  25.73 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  32.89 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.07 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  25 
 
 
486 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.82 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  31.43 
 
 
386 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  29.25 
 
 
371 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.78 
 
 
519 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.06 
 
 
487 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.06 
 
 
487 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0440  rhomboid family protein  35.97 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0337816  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  27.84 
 
 
356 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.16 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  27.46 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  34.51 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.58 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  29.71 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  30.2 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  28.28 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.33 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  30.59 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.82 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  28.57 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  32.81 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  36.9 
 
 
198 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  36.9 
 
 
198 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>