171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1385 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  100 
 
 		 293 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  28.42 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  28.42 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  32.97 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  30.48 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  31.06 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  32.38 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  31.67 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  31.06 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  31.06 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  29.55 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  30.93 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  29.19 
 
 		 281 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  29.11 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  30.25 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  28.86 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  30.72 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  28.52 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  30.24 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  29.15 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  29.21 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  30.03 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  30.03 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  30.03 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  30.72 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  30.03 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  27.89 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  30.03 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  30.03 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  30.03 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  29.11 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  29.93 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  30.58 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  29.53 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  29.25 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  29.49 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  28.33 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  28.87 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  27.21 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  29.97 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  33.47 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  37.77 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  26.74 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  30.96 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  27.05 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  40.52 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  36.65 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  39.86 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  35.68 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  26.64 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  35.68 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  32.78 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  41.3 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  46.22 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  27.65 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  32.73 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  38.93 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  33.06 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  28.99 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  26.46 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  25.89 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  28.82 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  32.64 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  41.18 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  31.01 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  32.76 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  28.96 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  32.76 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  36.8 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  32.09 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  36.09 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  31.85 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  32.03 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  38.38 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  35.42 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.19 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  40.79 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  30.59 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.72 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  40.54 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  34.02 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  32.81 
 
 		 528 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  37.35 
 
 		 487 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.02 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  37.35 
 
 		 487 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  34.02 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  37.93 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  29.84 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.29 
 
 		 519 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  40.51 
 
 		 207 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>