186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3276 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  100 
 
 		 430 aa  866    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  37.21 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  34.03 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  36.08 
 
 		 223 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36.09 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  37.23 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  35.66 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  35.66 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  35.66 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.27 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30.34 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  31.13 
 
 		 569 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.64 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  25.6 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  32.65 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  34.88 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  36.19 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  41.46 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  41.46 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.29 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.97 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  33.1 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  29.8 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  29.61 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  33.1 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  34.56 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  24.19 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  25.32 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  33.1 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  29.5 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  33.1 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  33.1 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  27.45 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  27.03 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  29.81 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  31.65 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  31.65 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  31.47 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  28.57 
 
 		 277 aa  57  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5280  hypothetical protein  27.73 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.274903  normal  0.237691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.39 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  33.81 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  31.41 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  29.63 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  29.29 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  27.88 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35.23 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  33.08 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  29.55 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  34.04 
 
 		 284 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  28.57 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.05 
 
 		 207 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  32.5 
 
 		 291 aa  54.7  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.66 
 
 		 190 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 190 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  29.79 
 
 		 268 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 190 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 190 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  32.99 
 
 		 224 aa  53.5  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  37.23 
 
 		 190 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  31.76 
 
 		 360 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 212 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  26.28 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  30.66 
 
 		 190 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  27.14 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  28.03 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  25.16 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  28.03 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  26.28 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  32.87 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  26.28 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  28.68 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  30.71 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  28.47 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  29.5 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  26.28 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 579 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  28 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  30.53 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  33.09 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  29.37 
 
 		 240 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.74 
 
 		 228 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  34.52 
 
 		 172 aa  50.8  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  29.58 
 
 		 224 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  26.7 
 
 		 280 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  29.2 
 
 		 279 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>