101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0982 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  100 
 
 		 283 aa  552  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2506  rhomboid-like protein  35.29 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1844  rhomboid family protein  41.46 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3108  Rhomboid family protein  40.12 
 
 		 343 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0967  rhomboid family protein  31.72 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0078595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  41.61 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2421  rhomboid family protein  37.89 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00797483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1329  Rhomboid family protein  32.43 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.29151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1665  rhomboid family protein  32.31 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  32.99 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2353  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2247  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2453  uncharacterized membrane protein  34.55 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1979  Rhomboid family protein  37.97 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.53 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  29.2 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  29.2 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  28.47 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  28.47 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32.19 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.4 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.4 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  27.74 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.22 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  29.38 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  27.59 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  29.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  29.05 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  42.57 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 547 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  36.26 
 
 		 541 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  27.01 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  28.65 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  29.75 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  29.89 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1385  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.159221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  33.12 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  32.02 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  28.75 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.21 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.01 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  25.69 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  33.97 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  28 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  32.87 
 
 		 371 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 511 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  26.06 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  33.92 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 186 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  31.73 
 
 		 208 aa  49.7  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.17 
 
 		 381 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  36.54 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  28.42 
 
 		 554 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  25.49 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  25.49 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  31.51 
 
 		 365 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  31.25 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  30.86 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  28.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  26.9 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  33.09 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  27.14 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  27.47 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  29.94 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  29.55 
 
 		 625 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  25.81 
 
 		 522 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  32.1 
 
 		 216 aa  45.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  27.21 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  30.56 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.6 
 
 		 625 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  33.04 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  29.22 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 		 625 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  27.43 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  27.59 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  30.6 
 
 		 625 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.38 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  26.35 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  31.97 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  25.71 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.25 
 
 		 579 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  28.21 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 422 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>