42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1385 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1385  Rhomboid family protein  100 
 
 		 325 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.159221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1844  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3108  Rhomboid family protein  41.8 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2421  rhomboid family protein  41.22 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00797483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1329  Rhomboid family protein  34.03 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.29151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2506  rhomboid-like protein  38.37 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2353  Rhomboid family protein  32.49 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0967  rhomboid family protein  34.63 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0078595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2453  uncharacterized membrane protein  36.48 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1979  Rhomboid family protein  33.2 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2247  Rhomboid family protein  33.2 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1665  rhomboid family protein  42.11 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  30.99 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.58 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.78 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.22 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  34.07 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  27.22 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  25.56 
 
 		 487 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  25.56 
 
 		 487 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.32 
 
 		 519 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  21.8 
 
 		 486 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  32.39 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  26.29 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  29.95 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  31.79 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  29.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  27.11 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  32.72 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  33.82 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  28.67 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  25.17 
 
 		 205 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  30.52 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  29.5 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  36.46 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  26.06 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  27.63 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  30.34 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>