74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2453 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2453  uncharacterized membrane protein  100 
 
 		 310 aa  607  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2247  Rhomboid family protein  47.68 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1979  Rhomboid family protein  46.51 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2506  rhomboid-like protein  48.24 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0967  rhomboid family protein  44.48 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0078595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2353  Rhomboid family protein  41.12 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1665  rhomboid family protein  46.92 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  46.75 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1329  Rhomboid family protein  39.43 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.29151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3108  Rhomboid family protein  46.24 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1844  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2421  rhomboid family protein  35.22 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00797483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  35.79 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  34.43 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1385  Rhomboid family protein  36.48 
 
 		 325 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.159221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.24 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  36.16 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  35.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  23.26 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  36.48 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.66 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  22.92 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  38.71 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  32.14 
 
 		 570 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.78 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  31.9 
 
 		 569 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  28.49 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.34 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.34 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  29.37 
 
 		 205 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.06 
 
 		 486 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  31.74 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  28.8 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  27.54 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.62 
 
 		 554 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.65 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.37 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  31.63 
 
 		 186 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 182 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  38.3 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  38.94 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  30.14 
 
 		 556 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  31.69 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  38.24 
 
 		 228 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  27.66 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.32 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  32.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  38.54 
 
 		 515 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  33.77 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  30.06 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  28.12 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35 
 
 		 511 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.52 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.96 
 
 		 226 aa  46.2  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  36.9 
 
 		 389 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  28.16 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  32.17 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  33.64 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  36.78 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  32.71 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  32.86 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  38 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.67 
 
 		 489 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  36.08 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  26.77 
 
 		 579 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>