113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2879 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  100 
 
 		 295 aa  564  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1979  Rhomboid family protein  40 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1329  Rhomboid family protein  42.13 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.29151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0967  rhomboid family protein  38.1 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0078595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2247  Rhomboid family protein  37.75 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2506  rhomboid-like protein  39.44 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2421  rhomboid family protein  40.22 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00797483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2453  uncharacterized membrane protein  36.09 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  39.17 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1665  rhomboid family protein  40.64 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2353  Rhomboid family protein  34.56 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1844  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3108  Rhomboid family protein  42.21 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  29.17 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  40.24 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  40.24 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.12 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  27.12 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  26.07 
 
 		 519 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  30.14 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  36.56 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  29.55 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 190 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.62 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  29.14 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  36.78 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1385  Rhomboid family protein  34.39 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.159221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  33.6 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  29.65 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.23 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  30.23 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.69 
 
 		 554 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  31.5 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  29.07 
 
 		 625 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  27.2 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.45 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  44.3 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  34.55 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  29.05 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.04 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  39.36 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  36.78 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 487 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 487 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  30.63 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  35.56 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  27.69 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  43.53 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  29.27 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  28.85 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  31.47 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  34.83 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  41.76 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  31.93 
 
 		 356 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5280  hypothetical protein  32 
 
 		 372 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.274903  normal  0.237691 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  37.36 
 
 		 570 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  35.92 
 
 		 365 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  32.62 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  30.86 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1441  Rhomboid family protein  30.36 
 
 		 192 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  32.14 
 
 		 430 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  38.64 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  31.87 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  41.98 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  26.57 
 
 		 513 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.62 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.62 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30.17 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 541 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.62 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 547 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 541 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  31.11 
 
 		 172 aa  46.2  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  27.65 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  28.67 
 
 		 205 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  33.72 
 
 		 523 aa  45.8  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  37.84 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.4 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  29.93 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  37.04 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  42.17 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.37 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  40.74 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  34.83 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  33.59 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  24.86 
 
 		 556 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>