67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1441 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1441  Rhomboid family protein  100 
 
 		 192 aa  360  5.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2170  rhomboid family protein  55.29 
 
 		 183 aa  171  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000411867 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  36.42 
 
 		 487 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  36.42 
 
 		 487 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  31.97 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.07 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  30.5 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.15 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.15 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  30.15 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  29.85 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.37 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  29.41 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  30.2 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  30.2 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  26.32 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  28.26 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  29.68 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  27.61 
 
 		 386 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  25.17 
 
 		 303 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  28.79 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  27.61 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  29.87 
 
 		 359 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  25.69 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  26.8 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  29.03 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  32.03 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  25.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  26.23 
 
 		 365 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  27.52 
 
 		 358 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  29.53 
 
 		 541 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  25.69 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.38 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  36.78 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  27.33 
 
 		 569 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  29.86 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  28.15 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  28.48 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  26.21 
 
 		 286 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  26.17 
 
 		 554 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 511 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  26.28 
 
 		 234 aa  44.7  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  26.57 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  28.68 
 
 		 306 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  29.83 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  23.16 
 
 		 282 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  27.81 
 
 		 669 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  29.53 
 
 		 556 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  27.52 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  27.52 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  27.52 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  25.34 
 
 		 284 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  23.33 
 
 		 356 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  27.78 
 
 		 275 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 292 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 190 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  28.17 
 
 		 295 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  27.61 
 
 		 219 aa  42  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  21.24 
 
 		 291 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  26.12 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  35.16 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  28.28 
 
 		 541 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>