More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0056 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  100 
 
 		 225 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.44 
 
 		 386 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  37.44 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  36.87 
 
 		 327 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  42.29 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  34.54 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  35.75 
 
 		 389 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  36.53 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  37.99 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  38.64 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.78 
 
 		 358 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.18 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.18 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.18 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  38.17 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  32.23 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  34.95 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  34.95 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.02 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  36.67 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.26 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.99 
 
 		 303 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  32.76 
 
 		 286 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  34.5 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 376 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  35.12 
 
 		 486 aa  99  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.01 
 
 		 342 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  38.62 
 
 		 365 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.96 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.01 
 
 		 342 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  34.39 
 
 		 569 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  32.87 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  35.83 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  32.29 
 
 		 554 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  34.24 
 
 		 268 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  34.31 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  35.91 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  33.64 
 
 		 511 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.69 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.96 
 
 		 303 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.5 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  28.76 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  38.35 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  35.05 
 
 		 336 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.18 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.18 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.42 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.55 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  27.88 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  31.74 
 
 		 298 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.19 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  37.67 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  31.93 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.76 
 
 		 523 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  30.81 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  30.27 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  30.63 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  30.73 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.8 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.3 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  32.86 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  27.68 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  36.18 
 
 		 556 aa  72.8  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  32.07 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  29.58 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  30.53 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.53 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  32 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  33.07 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  32.81 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  33.57 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.58 
 
 		 625 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 625 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  31.58 
 
 		 625 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 369 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  29.77 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  35.26 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  29.32 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  28.74 
 
 		 579 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 281 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  37.21 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  32.09 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  31.84 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  29.38 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  34.31 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  35.96 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2815  rhomboid family protein  29.51 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  36.96 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>