More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0685 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  95.68 
 
 		 625 aa  1207    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  95.68 
 
 		 625 aa  1207    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  95.36 
 
 		 625 aa  1201    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  94.72 
 
 		 625 aa  1190    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  100 
 
 		 625 aa  1278    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  28.53 
 
 		 639 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.52 
 
 		 541 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  38.19 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  29.06 
 
 		 486 aa  102  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  38.59 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  33.87 
 
 		 487 aa  101  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  33.87 
 
 		 487 aa  101  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.49 
 
 		 236 aa  101  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  39.74 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  34.4 
 
 		 386 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  40.91 
 
 		 513 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  41.06 
 
 		 358 aa  97.4  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  35.9 
 
 		 519 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  39.16 
 
 		 554 aa  97.4  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  36.7 
 
 		 356 aa  95.9  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  34.24 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  34.24 
 
 		 541 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 511 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  31.84 
 
 		 396 aa  91.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 342 aa  91.3  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  35.98 
 
 		 226 aa  91.3  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.39 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 286 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 219 aa  88.2  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 342 aa  87.4  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  34.39 
 
 		 348 aa  87.4  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  34.98 
 
 		 248 aa  87  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  39.6 
 
 		 371 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  37.16 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  39.31 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  37.16 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  38.62 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  36.88 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  36.87 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  32.04 
 
 		 669 aa  77.4  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.16 
 
 		 228 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  33.96 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.26 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  33.88 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  33.33 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.91 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  33.13 
 
 		 360 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 360 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  34.67 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  34.84 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 689 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  31.79 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  33.59 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.61 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.36 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 190 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.26 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  41.57 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 190 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  33.15 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  33.59 
 
 		 172 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  31.88 
 
 		 190 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  32.64 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  32.47 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  35.95 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  30.77 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.93 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  27.32 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 190 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  32.81 
 
 		 172 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  30 
 
 		 224 aa  67  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  30.14 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  34.16 
 
 		 228 aa  67  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.51 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  34.27 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  29.61 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  32.52 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  34.56 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  32.9 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  27.5 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 776 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  32.54 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  31.94 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.52 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>