283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4044 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  100 
 
 		 513 aa  1043    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  32.23 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.92 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.3 
 
 		 358 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  32.64 
 
 		 569 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.41 
 
 		 554 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  31.78 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.65 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  31.86 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.72 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.15 
 
 		 547 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.03 
 
 		 342 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 541 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  35.23 
 
 		 386 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.65 
 
 		 365 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.94 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.94 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  32.11 
 
 		 528 aa  87  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  31.19 
 
 		 520 aa  87  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  38.03 
 
 		 283 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  31.19 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  40.43 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  37.01 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  30.69 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  39.16 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.16 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  39.16 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  39.16 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 223 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  37.18 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.58 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  38.46 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.1 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  36.3 
 
 		 235 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  36.3 
 
 		 235 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  28.86 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  36.11 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.88 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 291 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.16 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.95 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  25.86 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  30.72 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  35.29 
 
 		 669 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  31.82 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 234 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 225 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  36.3 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  35.1 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  35.1 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.8 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  27.34 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.25 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2679  Rhomboid family protein  43.42 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  36.22 
 
 		 281 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  34.53 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  30.82 
 
 		 141 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  32.73 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  34.53 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.95 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.25 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  33.06 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  40.15 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  30.23 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  34.59 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  34.59 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  28.23 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.83 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  30.77 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.97 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  26.41 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  33.08 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  34.81 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  34.81 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  31.47 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  34.64 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.74 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  34.06 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  32.1 
 
 		 292 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.24 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  29.13 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.93 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  34.81 
 
 		 238 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.21 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  28.63 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2385  rhomboid-like protein  35.66 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  34.06 
 
 		 286 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  29.49 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>