171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0904 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  100 
 
 		 284 aa  566  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2385  rhomboid-like protein  55.8 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1637  rhomboid family protein  52.55 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2186  rhomboid family protein  49.63 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0462  Rhomboid family protein  56.16 
 
 		 238 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0479  Rhomboid family protein  50.59 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000451425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1188  rhomboid family protein  59.52 
 
 		 181 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0257893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  38.41 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  29.55 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  30.13 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  39.87 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  41.78 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.89 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  36.76 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.32 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.46 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  29.77 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  29.18 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  38.16 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  33.69 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  30.28 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.7 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.7 
 
 		 569 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  32.43 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  30.95 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34.72 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  27.35 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  34.07 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  34.97 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  26.86 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  35.56 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  35.56 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  29.55 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  34.69 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  31.44 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  27.57 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  27.92 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  27.92 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  31.18 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  36.31 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  34.55 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  36.67 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.01 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  34.55 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  32.87 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  29.37 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  29.59 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  35.56 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  30.43 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  29.28 
 
 		 570 aa  62.4  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  28.63 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  25.12 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  27.94 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  35.17 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.09 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1187  hypothetical protein  82.14 
 
 		 36 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  34.67 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  35.38 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  29.63 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  31.74 
 
 		 747 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  28.63 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  34.81 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  32.47 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  28.75 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  31.97 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  27.19 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  28.9 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  35.21 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.45 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  31.65 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  25.68 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.17 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  26.44 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  27.16 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.67 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  27.12 
 
 		 669 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  29.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 		 422 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  32.03 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  28.4 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  30.94 
 
 		 362 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  30.43 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  31.13 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.08 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.71 
 
 		 579 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  27.53 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  29.69 
 
 		 523 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>