50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1844 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1844  rhomboid family protein  100 
 
 		 337 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3108  Rhomboid family protein  56.54 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2421  rhomboid family protein  44.8 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00797483  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1385  Rhomboid family protein  39.73 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.159221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2506  rhomboid-like protein  39.93 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2353  Rhomboid family protein  40.64 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0967  rhomboid family protein  33.45 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0078595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  40.85 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1329  Rhomboid family protein  38.15 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.29151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1665  rhomboid family protein  44.79 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1979  Rhomboid family protein  47.88 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2247  Rhomboid family protein  41.45 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2453  uncharacterized membrane protein  35.81 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  37.45 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  41.77 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  27.14 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  31.18 
 
 		 570 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  30 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 186 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  25.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  25.17 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  32.14 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  25.17 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  27.15 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  27.15 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  23.13 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  30.91 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  28.24 
 
 		 190 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  28.24 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  28.24 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  27.33 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.8 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  28.24 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  28.24 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  25 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.5 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  25 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  36.13 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  30.77 
 
 		 228 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  36.13 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  28.48 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  27.37 
 
 		 205 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  27.75 
 
 		 669 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  29.35 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  28.5 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>