More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1015 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  99.59 
 
 
246 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  97.97 
 
 
246 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  72.06 
 
 
247 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  48.09 
 
 
241 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  44.58 
 
 
240 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  45.53 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  42.86 
 
 
225 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  43.46 
 
 
215 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  40.71 
 
 
234 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  40.43 
 
 
224 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  43.53 
 
 
221 aa  168  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  46.25 
 
 
246 aa  168  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  43.28 
 
 
218 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  44.44 
 
 
239 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  44.67 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  39.09 
 
 
236 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  39.68 
 
 
232 aa  158  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  42.61 
 
 
284 aa  158  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  46.81 
 
 
258 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  43.21 
 
 
220 aa  158  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  41.35 
 
 
252 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  43.45 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  41.43 
 
 
245 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  41.81 
 
 
211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  43.75 
 
 
243 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  39.51 
 
 
223 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  41.15 
 
 
246 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  40.4 
 
 
232 aa  148  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  43.9 
 
 
230 aa  148  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  37.7 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  42.15 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  40.96 
 
 
231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  40.66 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  42.35 
 
 
251 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  41.53 
 
 
228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  39.11 
 
 
239 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  49.42 
 
 
260 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  40.98 
 
 
264 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  48.09 
 
 
231 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  37.3 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  36.48 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  49.32 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  43.53 
 
 
256 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  38.4 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  47.37 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  38.15 
 
 
248 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  38 
 
 
231 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  40.16 
 
 
227 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  35.94 
 
 
252 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  39.29 
 
 
247 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  39.2 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  39.33 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  51.23 
 
 
232 aa  135  8e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  38.66 
 
 
237 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  35.83 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  39.13 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  47.74 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  37.6 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  36.9 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  42.92 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  38.13 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  34.73 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  33.33 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  39.38 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  47.41 
 
 
246 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  37.15 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  46.98 
 
 
246 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  40 
 
 
237 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  37.79 
 
 
298 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  45.34 
 
 
265 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  37.55 
 
 
227 aa  121  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  39.18 
 
 
362 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  43.48 
 
 
261 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  36.65 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  38.52 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  39.81 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  43.71 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  33.61 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  36.24 
 
 
360 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  36.24 
 
 
360 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  34.6 
 
 
251 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  33.47 
 
 
360 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1551  rhomboid-like protein  33.03 
 
 
231 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  34.17 
 
 
371 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  34.93 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  30.52 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  35.29 
 
 
273 aa  95.1  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  38.22 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  39.22 
 
 
209 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  37.58 
 
 
197 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  35.75 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.75 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  36.14 
 
 
226 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.76 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  34.02 
 
 
360 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  36.97 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  37.58 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.7 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  37.89 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>