278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0365 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0329  rhomboid family protein  99.56 
 
 		 226 aa  427  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  77.62 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  70.8 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  33.18 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  40.82 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  36.47 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  40.24 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  36.47 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  35.45 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  39.38 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  40.69 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  39.87 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  40.14 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  34.95 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  34.54 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  42 
 
 		 267 aa  92.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  30.04 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  40 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  31.43 
 
 		 284 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.18 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  40.27 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.44 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  39.73 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  33.02 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  37.91 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  33.93 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  29.86 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  33.88 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  33.99 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  38.62 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  35.93 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  27.95 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  30.59 
 
 		 289 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  38.55 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  30.28 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  33.8 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  36.63 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  28.99 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  38.51 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.91 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  32.86 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  31.34 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  31.31 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  38.19 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  35.46 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  28.82 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  30.52 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  35.8 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  37.14 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  38.51 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  37.91 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  36.81 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  39.6 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  34.8 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  33.76 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  43.54 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  34.46 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  33.48 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  34.25 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  32.35 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  33.76 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  33.48 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  36.97 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  39.41 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  39.41 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1551  rhomboid-like protein  38.54 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  32.97 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3678  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0309467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  29.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  29.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  30.57 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  30.67 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  34.69 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  28.4 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  34.9 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  32.86 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  28.4 
 
 		 172 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  36.91 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  38.82 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  37.78 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  34.01 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>