More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2146 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2142  chemotaxis sensory transducer  83.09 
 
 
485 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
485 aa  939    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.08 
 
 
490 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0031  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 
485 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3822  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.8 
 
 
509 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.275517  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
537 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.765764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
567 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  38.21 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
688 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 
562 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  38.13 
 
 
565 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 
688 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 
662 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  39.13 
 
 
561 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.29 
 
 
561 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  38.85 
 
 
562 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 
572 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  37.29 
 
 
566 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
681 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  41.24 
 
 
688 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
566 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 
673 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  38.31 
 
 
568 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.08 
 
 
563 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4292  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
535 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
674 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 
567 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 
573 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
434 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 
577 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
655 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
561 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 
568 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
656 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 
561 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 
675 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
672 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.63 
 
 
542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.57 
 
 
564 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.17 
 
 
567 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1739  chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
559 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 
561 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
730 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 
540 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 
731 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 
587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
714 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  43.78 
 
 
716 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  40.91 
 
 
691 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 
656 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
561 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
561 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 
655 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
644 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
674 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0534  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  39.69 
 
 
733 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
688 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
730 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 
691 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 
689 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 
688 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 
566 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
681 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 
559 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.91 
 
 
656 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
741 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
564 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 
674 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.62 
 
 
556 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  41.15 
 
 
569 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
562 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.26 
 
 
691 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 
602 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3665  chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
567 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3907  chemotaxis sensory transducer  43.08 
 
 
424 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 
434 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 
559 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  37.13 
 
 
698 aa  150  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.56 
 
 
716 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0120  chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
445 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.118781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 
670 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
686 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.13 
 
 
676 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0533  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  39.85 
 
 
712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.595703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 
568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 
563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  40.15 
 
 
565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 
690 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 
689 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
694 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 
716 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.75 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 
560 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0809  chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 
717 aa  147  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>