291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2348 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2348  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 382 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 551 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 431 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 325 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 406 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 782 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 764 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.05 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.77 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 348 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 414 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 392 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3488  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.387521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 1093 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 1093 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 2693 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 878 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 492 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 1714 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  27.06 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 909 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 767 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 1560 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1654 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  26.94 
 
 		 624 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  28.26 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 871 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 839 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 382 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 439 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 739 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 875 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 945 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 1676 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.17 
 
 		 895 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 732 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 1390 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1177 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 3706 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 1239 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 681 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.7 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  27.43 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.06 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 362 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  24.87 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1210 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 1183 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 585 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 757 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 874 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.18 
 
 		 744 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1093 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 771 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 657 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  28.98 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 674 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 964 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.66 
 
 		 1248 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1289 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 353 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 864 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1182 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 494 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 941 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 387 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>