219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3488 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.387521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2348  putative signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 864 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 749 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  28.79 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  21.29 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 681 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 594 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.75 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 764 aa  58.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.74 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 		 875 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  22.28 
 
 		 895 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  25.73 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25.26 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 406 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  20.69 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 2693 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 1227 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 945 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 616 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 398 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0830  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.78 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00637063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 551 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 532 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 3706 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 381 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  28.08 
 
 		 544 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  21.78 
 
 		 365 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 578 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 356 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 541 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 774 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.43 
 
 		 871 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 382 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 		 733 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 613 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 839 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 648 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25.84 
 
 		 381 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 732 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  26.11 
 
 		 387 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 603 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 739 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 816 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0971  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.2 
 
 		 567 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 492 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  25.62 
 
 		 783 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 460 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 508 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 501 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 597 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 728 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 872 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 		 461 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 807 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  21.29 
 
 		 723 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 767 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  23.88 
 
 		 494 aa  49.3  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 856 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 1390 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 368 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  25.71 
 
 		 728 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 936 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 362 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4194  ATPase-like/sensor kinase  27.46 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  21.72 
 
 		 752 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  24.59 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0795  histidine kinase  27.98 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.782448  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.37 
 
 		 849 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0684  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  25.58 
 
 		 600 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000102033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>