More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3564 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
594 aa  1194    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
597 aa  318  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
593 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
593 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
662 aa  137  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
603 aa  130  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
1654 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
570 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
1093 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
1093 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
532 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
874 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
875 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.78 
 
 
895 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
1390 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
774 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
1253 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
1093 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1714 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
771 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
526 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
596 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
3706 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
1560 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
871 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
752 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
764 aa  103  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
1183 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
732 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
462 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  34.13 
 
 
624 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
585 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
945 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
681 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
807 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.14 
 
 
1239 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
813 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
757 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
362 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
511 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
815 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
2693 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
991 aa  98.2  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
362 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
362 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
980 aa  97.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
941 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  31.47 
 
 
650 aa  97.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
839 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
746 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
747 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
767 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
964 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
362 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
872 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
363 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
551 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
856 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
1246 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.65 
 
 
1663 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.45 
 
 
754 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
437 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
1676 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
472 aa  94.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
215 aa  94  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.71 
 
 
348 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
723 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
348 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
361 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
360 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
348 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
1177 aa  93.2  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
749 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.45 
 
 
1668 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
354 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
439 aa  92  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
382 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.51 
 
 
783 aa  90.5  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
376 aa  90.5  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
488 aa  90.5  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
932 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
693 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
771 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
790 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
572 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.12 
 
 
1182 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  30.26 
 
 
344 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  30 
 
 
547 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  28.7 
 
 
492 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
659 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
349 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
416 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.67 
 
 
936 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
674 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.81 
 
 
945 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>