More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4194 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4194  ATPase-like/sensor kinase  100 
 
 		 344 aa  691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  79.41 
 
 		 344 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 215 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 945 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 681 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 980 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 547 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.58 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 1246 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 1676 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  30.62 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 420 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 382 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 991 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 526 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 767 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 913 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 739 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 462 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 648 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 756 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 613 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  25.71 
 
 		 744 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 834 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 1654 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 1560 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 1714 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 1227 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 		 572 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 551 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 674 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 362 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 1239 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 1253 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1051 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 941 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 1177 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 511 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 872 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 408 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 616 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 788 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 492 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 2693 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 932 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 964 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 520 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 892 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 839 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 489 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 541 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 414 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  27.72 
 
 		 754 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3214  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 540 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 3706 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 764 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 732 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 936 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 1093 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  24.47 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 1051 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 782 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  32.34 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 771 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 1093 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.31 
 
 		 783 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 1093 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 790 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 1390 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 693 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.83 
 
 		 918 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 545 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>