More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0795 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0795  histidine kinase  100 
 
 		 494 aa  993    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.782448  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1559  ATP-binding region, ATPase-like  39.35 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  33.96 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  33.96 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 1229 aa  83.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 658 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  25.94 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.4 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 591 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  28.33 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 1226 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 591 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  24.86 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  28.57 
 
 		 659 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  30.58 
 
 		 670 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 1101 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  30.91 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  28.93 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  27.86 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  28.06 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  27.88 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.09 
 
 		 1048 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.57 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  28.57 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  30.92 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.45 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  32.99 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  31.96 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  30.5 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  34 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  30.26 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  29.69 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  28.16 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  27.54 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  24.93 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 595 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.75 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0011  histidine kinase  29.06 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  28.43 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  30.05 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  25.5 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  27.8 
 
 		 1033 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  28.5 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  28.39 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.99 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  26.9 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  28.99 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  28.35 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 799 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  29.69 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  25.84 
 
 		 1031 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  25.56 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.19 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  28.22 
 
 		 740 aa  67  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  26.14 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  29.13 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  29.47 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  27.75 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 770 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  27.46 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  26.63 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  27.64 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  25.51 
 
 		 632 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  29.86 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>