192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4222 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4222  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  734    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.37 
 
 		 1480 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  32.21 
 
 		 999 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  26.58 
 
 		 1156 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  26.9 
 
 		 1499 aa  99.4  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.06 
 
 		 855 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.98 
 
 		 2954 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.56 
 
 		 3598 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.96 
 
 		 2689 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  27.36 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.01 
 
 		 2678 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30 
 
 		 1279 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  28.57 
 
 		 860 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  27.92 
 
 		 959 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1306 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 2107 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.18 
 
 		 820 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  25.28 
 
 		 5769 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.06 
 
 		 1236 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  37.11 
 
 		 4678 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  23.92 
 
 		 2245 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.66 
 
 		 4798 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.2 
 
 		 946 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.98 
 
 		 1166 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  28.33 
 
 		 856 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  25.51 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  25.29 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  27.31 
 
 		 942 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  29.91 
 
 		 889 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  26.52 
 
 		 2911 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  28.12 
 
 		 2836 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.08 
 
 		 3209 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.8 
 
 		 1400 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  26.43 
 
 		 518 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  26.64 
 
 		 1403 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  27.4 
 
 		 1055 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.18 
 
 		 219 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  26.16 
 
 		 1168 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  24.02 
 
 		 824 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.54 
 
 		 2105 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.08 
 
 		 1197 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 467 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.21 
 
 		 1180 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 1607 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  25.56 
 
 		 2467 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 561 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  25.69 
 
 		 1839 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 		 1795 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.37 
 
 		 1884 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  25.97 
 
 		 1534 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  38.82 
 
 		 874 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  31.71 
 
 		 940 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  24.15 
 
 		 1814 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  31.13 
 
 		 1383 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  26.09 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  26.09 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  38.16 
 
 		 8682 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.11 
 
 		 2542 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  23.5 
 
 		 3954 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  26.58 
 
 		 2667 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  26.35 
 
 		 491 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.39 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.66 
 
 		 9030 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.24 
 
 		 1610 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.29 
 
 		 2807 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.19 
 
 		 1415 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  35.11 
 
 		 621 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  24.62 
 
 		 1079 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  36.19 
 
 		 785 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  42.11 
 
 		 1883 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  31.58 
 
 		 526 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.47 
 
 		 1019 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  39.73 
 
 		 5218 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  25.83 
 
 		 7284 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.11 
 
 		 3427 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  37.63 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  26.57 
 
 		 858 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  25.88 
 
 		 4334 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.23 
 
 		 2239 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.29 
 
 		 4106 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  24.9 
 
 		 745 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.73 
 
 		 5962 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  27.18 
 
 		 623 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.45 
 
 		 4687 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  41.38 
 
 		 9867 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.56 
 
 		 5839 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 1502 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  32.76 
 
 		 2784 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  32.59 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  38.55 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  32.26 
 
 		 709 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  25.32 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 		 547 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  37.78 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  42.86 
 
 		 1394 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.61 
 
 		 4836 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.36 
 
 		 980 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  27.94 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.4 
 
 		 4800 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>