More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29500  putative type II secretion system protein  100 
 
 		 395 aa  774    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2647  type II secretion system protein  43.97 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16160  type II secretion system protein  45.61 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.996237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3231  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0387255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.62 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  26.65 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  26 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30.05 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  27 
 
 		 419 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  28.25 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  28.68 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.67 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.5 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  26.93 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  31.08 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  29 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  28.9 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  29.32 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  31.3 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  29.08 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  28.64 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  24.81 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  28.64 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  28.61 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  28.13 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.25 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.55 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  25.69 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.89 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  24.36 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  25.69 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1048  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  27.57 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3028  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000329873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  27.75 
 
 		 422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  30.35 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1089  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.419193  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  24.37 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  26.58 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 417 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  27.48 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 406 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  25.37 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  27.54 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  28.75 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  27.98 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  32.76 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.67 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  25 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  28.78 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  30.12 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  29.03 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  28.05 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  25.32 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  25 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  27.05 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  28.85 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  28.01 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 420 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  23.08 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>