More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4448 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  100 
 
 		 419 aa  850    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  68.24 
 
 		 402 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  64.13 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  61.58 
 
 		 422 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  60.28 
 
 		 423 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  67 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  61.58 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  62.41 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  61.67 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  61.9 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  62.56 
 
 		 419 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  61.78 
 
 		 422 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  60.52 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  62.38 
 
 		 421 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  62.53 
 
 		 423 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  60.28 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  60.62 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  61.58 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  62.41 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  60.25 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  57.75 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  57.39 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  61.56 
 
 		 410 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  56.39 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  58.29 
 
 		 403 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  62.57 
 
 		 373 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  54.73 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  56.05 
 
 		 405 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  57.53 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  58.27 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  54.57 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  51.92 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  50.61 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  54.7 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  49.39 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  48.92 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  53.12 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  49.13 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  49.15 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  50.38 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  52.87 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0063  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilC  55.78 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000657868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0068  type II secretion system protein  55.03 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000163403  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  49.13 
 
 		 405 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  49 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  48.76 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  49.62 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  49.15 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  47.16 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  51.26 
 
 		 412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  49.38 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  47.95 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  48.06 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  50 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  47.56 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  47.01 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  46.52 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  48.32 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  49.87 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  47.88 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  51.38 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  47.56 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  48.76 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  46.32 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  44.42 
 
 		 408 aa  359  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  43.68 
 
 		 410 aa  359  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  42.17 
 
 		 407 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  42.21 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.48 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  43.46 
 
 		 405 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  42 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  42 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  41.71 
 
 		 417 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  40.35 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  40.95 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  41.21 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  40.25 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  40 
 
 		 404 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  39.9 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  39.4 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  38.35 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  40.25 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  38.35 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  38.31 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  39.85 
 
 		 419 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  38.44 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0633  type IV pili biogenesis protein PilC  38.6 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0674  type II secretion system protein  38.6 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  37.11 
 
 		 417 aa  275  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  37.19 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.78 
 
 		 406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4537  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  35.24 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  35.82 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  39.35 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  35.57 
 
 		 410 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  36.43 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>