More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1300 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  100 
 
 		 405 aa  810    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  61.12 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0687  type II secretion system protein  60.34 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  39.61 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  42.42 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  35.82 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.98 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  36.21 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  31.2 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  33.67 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  30.85 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 404 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 422 aa  219  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  31.11 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.33 
 
 		 408 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  31.39 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  33.33 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  34.15 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  32.51 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.51 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  32.36 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.4 
 
 		 417 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.5 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  29.4 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  28.17 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  31.37 
 
 		 407 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.22 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  32.67 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  33.01 
 
 		 403 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  30.85 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  32.27 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  31.93 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  30.4 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  32.18 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  27.16 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.15 
 
 		 403 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  31.93 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  30.7 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  31.44 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  31.44 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  31.44 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  30.22 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.65 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  32.52 
 
 		 403 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  30.22 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  30.22 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  30.22 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  30.64 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  30.64 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  27.79 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  28.75 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  31.68 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>