More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02677 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 405 aa  803    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  75.12 
 
 		 406 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  68.64 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  68.89 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  45.21 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  41.52 
 
 		 410 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  47.16 
 
 		 400 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  47.42 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  46.25 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.38 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  35.42 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  35.82 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  35.7 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  32.43 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  34.95 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  34.95 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  34.95 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 406 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  33.02 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  35.71 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.43 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  30.52 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 405 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 395 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33.41 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  34.98 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 417 aa  216  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.63 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  34.31 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  34.58 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  31.22 
 
 		 463 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 417 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 419 aa  213  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.27 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  35.44 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  31.85 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  33.99 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  33.42 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  30.37 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 405 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  33.66 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.37 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  33.83 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  30.9 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.53 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  33 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.77 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  35.06 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33.25 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.76 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  35.32 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  32.28 
 
 		 413 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 421 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 406 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  33.33 
 
 		 400 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  33.17 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  33.01 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  33.17 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  33.17 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  29.51 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  30.98 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  36.03 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>