More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0857 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  100 
 
 		 405 aa  804    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  98.77 
 
 		 405 aa  795    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  68.64 
 
 		 405 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0547  type II secretion system protein  66.75 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0476697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  46.42 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  44.2 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  45.68 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  40.54 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  35.92 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1115  general secretion pathway protein F  41.37 
 
 		 364 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.17 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  34.72 
 
 		 409 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  32.68 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  36.97 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  33.83 
 
 		 403 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  34.72 
 
 		 409 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  34.72 
 
 		 409 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  34.19 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.2 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33.74 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  33.74 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  34.15 
 
 		 409 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  34.24 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  32.51 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  33.01 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.2 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  31.44 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  31.36 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1525  type II secretion system protein  34.52 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  31.33 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  29.98 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  33.74 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  34.89 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 419 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  34.24 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.92 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0663  general secretion pathway protein F  34.56 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0642  general secretion pathway protein F  34.56 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  33.64 
 
 		 439 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  32.11 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  32.76 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  30.24 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  31.95 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  34.48 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  31.59 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  33.66 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.82 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 410 aa  200  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 417 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 417 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  30.86 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  32.59 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  31.07 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  33.58 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  31.77 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  30.27 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  32.84 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  31.87 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  31.87 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  31.87 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  33.09 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  31.87 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  31.71 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  31.78 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 407 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  31.7 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.6 
 
 		 402 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>