More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0060 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  95.31 
 
 		 405 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  94.07 
 
 		 405 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  94.07 
 
 		 405 aa  761    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  94.07 
 
 		 405 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  94.07 
 
 		 405 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  94.07 
 
 		 405 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  98.27 
 
 		 405 aa  792    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  84.69 
 
 		 405 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  87.9 
 
 		 405 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  93.09 
 
 		 405 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  98.27 
 
 		 405 aa  791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  93.83 
 
 		 405 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  86.67 
 
 		 405 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 405 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  98.27 
 
 		 405 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  99.75 
 
 		 405 aa  802    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  94.07 
 
 		 405 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  98.27 
 
 		 405 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  86.42 
 
 		 405 aa  706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  66.91 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  66.67 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  65.76 
 
 		 403 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  65.27 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  65.11 
 
 		 403 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  53.56 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  51.11 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  52.44 
 
 		 410 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  51.46 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  51.82 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  52.35 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  52.59 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  51.58 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  50.24 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  50.25 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  49.63 
 
 		 405 aa  355  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  43.46 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  43.32 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  47.54 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  43.46 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  44.25 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  46.42 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0663  general secretion pathway protein F  50.61 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0642  general secretion pathway protein F  50.61 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  50 
 
 		 412 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  41.71 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  45.68 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  41.23 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  45.43 
 
 		 405 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  40.49 
 
 		 407 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  40.49 
 
 		 407 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  40.49 
 
 		 407 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  40.49 
 
 		 407 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  40.74 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3974  general secretion pathway protein F  48.66 
 
 		 411 aa  332  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  46.83 
 
 		 410 aa  332  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  40.99 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  41.48 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  40.35 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  40.84 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  39.36 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  40.74 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  46.96 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  41.73 
 
 		 407 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  42.82 
 
 		 408 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 		 413 aa  319  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  43.1 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  40 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  40.25 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  40.25 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  40 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  45.43 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  44.61 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  45.54 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  41.52 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 408 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  40.35 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  39.85 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  40.89 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  39.45 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  41.81 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2531  general secretion pathway protein F  46.83 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  39.41 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  38.39 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  38.14 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  38.33 
 
 		 407 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  38.14 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  38.14 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  37.59 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  40.94 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 404 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 411 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  37.84 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  37.35 
 
 		 409 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  34.83 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  34.83 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  34.83 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  34.83 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  34.83 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>