More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0544 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 411 aa  804    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  73.3 
 
 		 412 aa  594  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  74.34 
 
 		 410 aa  587  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  72.51 
 
 		 408 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  72.51 
 
 		 411 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  72.88 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0663  general secretion pathway protein F  72.26 
 
 		 409 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3974  general secretion pathway protein F  73.48 
 
 		 411 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0642  general secretion pathway protein F  72.26 
 
 		 409 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3429  general secretion pathway protein F  68.61 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  69.1 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  52.07 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  51.09 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  51.34 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  51.82 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  51.09 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  51.57 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  50.12 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  51.82 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  50.85 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  50.85 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  50.36 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  50.85 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  50.36 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  52.29 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  51.2 
 
 		 405 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  52.06 
 
 		 403 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  52.06 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  50.97 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  46.72 
 
 		 399 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  44.28 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  44.53 
 
 		 404 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  44.53 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  37.8 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  39.02 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  39.27 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  40.73 
 
 		 405 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  37.56 
 
 		 407 aa  282  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  40.98 
 
 		 405 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  37.71 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  37.07 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  43.75 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  37.32 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  38.44 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  38.2 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  38.69 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  36.59 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  39.18 
 
 		 407 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  38.44 
 
 		 407 aa  266  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  38.35 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  38.93 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  38.93 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  38.05 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  40.15 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  38.93 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  39.32 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  37.8 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  38.29 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  36.1 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  38.05 
 
 		 407 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  37.8 
 
 		 407 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  36.47 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  38.05 
 
 		 407 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  38.78 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  37.8 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  36.59 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  34.54 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  39.62 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  41.12 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2531  general secretion pathway protein F  43.93 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  35.25 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  39.81 
 
 		 410 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  35.52 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  35.48 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  38.54 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  34.55 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  34.4 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  36.52 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  38.01 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  37.32 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  34.06 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  36.06 
 
 		 409 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  37.35 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  38.01 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  38.01 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.28 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  31.62 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  31.62 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>