More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0728 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  100 
 
 
409 aa  812    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  79.71 
 
 
409 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  79.71 
 
 
409 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  79.71 
 
 
409 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  47.8 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  41.3 
 
 
409 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  37.56 
 
 
401 aa  319  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  35.45 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  35.54 
 
 
403 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  36.17 
 
 
405 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  34.96 
 
 
404 aa  298  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  36.43 
 
 
405 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  38.54 
 
 
406 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  38.81 
 
 
402 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 
407 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  37.96 
 
 
405 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  38.42 
 
 
403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  37.98 
 
 
401 aa  289  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  37.96 
 
 
406 aa  289  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  39.5 
 
 
417 aa  288  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  38.42 
 
 
406 aa  288  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  36.78 
 
 
419 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  37.47 
 
 
407 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.41 
 
 
405 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  38.59 
 
 
407 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  37.96 
 
 
410 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  36.8 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  35.45 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  36.27 
 
 
405 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  36.25 
 
 
405 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  37.9 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  39.51 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  36.01 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  35.85 
 
 
404 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  38.92 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  38.67 
 
 
405 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  37.71 
 
 
407 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  35.29 
 
 
406 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  40.05 
 
 
403 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  38.42 
 
 
400 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  38.46 
 
 
401 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  38.33 
 
 
404 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  40.88 
 
 
408 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  37.96 
 
 
407 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  38.67 
 
 
400 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  37.65 
 
 
422 aa  276  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  39.71 
 
 
408 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  37.68 
 
 
408 aa  276  7e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  37.99 
 
 
406 aa  276  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  38.12 
 
 
402 aa  276  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  35.31 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  37.41 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  38.82 
 
 
405 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  37.68 
 
 
403 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  38.82 
 
 
405 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  34.83 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  37.47 
 
 
407 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  37.47 
 
 
407 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  38.57 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  38.57 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  38.57 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  38.57 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  38.57 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  38.57 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  37.75 
 
 
409 aa  272  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  36.23 
 
 
417 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
403 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  36.98 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.39 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  34.91 
 
 
417 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  34.66 
 
 
417 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 
403 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  36.92 
 
 
407 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  36.1 
 
 
410 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.24 
 
 
406 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  39.47 
 
 
410 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  34.72 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  37.75 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  34.9 
 
 
404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  35.71 
 
 
417 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  34.9 
 
 
404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  38.08 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  34.9 
 
 
407 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  39.51 
 
 
407 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  39.51 
 
 
407 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  39.51 
 
 
407 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  39.66 
 
 
407 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  39.02 
 
 
407 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.22 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  36.67 
 
 
408 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  34.41 
 
 
407 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  37.59 
 
 
405 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>