More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0374 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  76.41 
 
 
407 aa  657    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  100 
 
 
407 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  63.39 
 
 
404 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  63.39 
 
 
404 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  64.62 
 
 
404 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  61.58 
 
 
406 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  56.17 
 
 
410 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  55.77 
 
 
377 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  47.76 
 
 
426 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  42.26 
 
 
406 aa  330  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  41.18 
 
 
406 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  43.34 
 
 
406 aa  328  8e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  40.79 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  42.16 
 
 
401 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  41.85 
 
 
405 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  41.03 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  40.05 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  40.92 
 
 
408 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  41.61 
 
 
405 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  42.54 
 
 
405 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  40.93 
 
 
409 aa  316  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  40.84 
 
 
409 aa  315  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  41.03 
 
 
407 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  40.84 
 
 
410 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  43.95 
 
 
403 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  38.5 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  42.75 
 
 
401 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  38.73 
 
 
403 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  38.58 
 
 
408 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  38.29 
 
 
417 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  37 
 
 
402 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  39.55 
 
 
417 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  37.59 
 
 
411 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  37.25 
 
 
416 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  37.78 
 
 
417 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  37.06 
 
 
417 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  38.48 
 
 
405 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  37.91 
 
 
419 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  38.21 
 
 
409 aa  289  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  38.48 
 
 
405 aa  289  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  37.99 
 
 
403 aa  289  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  42.94 
 
 
417 aa  288  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  37.75 
 
 
405 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  40.74 
 
 
403 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  38.5 
 
 
405 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  37.91 
 
 
422 aa  286  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  38.63 
 
 
406 aa  285  8e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  36.91 
 
 
407 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  37.35 
 
 
403 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  38.31 
 
 
409 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  37.47 
 
 
419 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  37.38 
 
 
408 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  39.61 
 
 
404 aa  276  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  36.55 
 
 
408 aa  276  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  35.84 
 
 
405 aa  276  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  36.25 
 
 
405 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  35.24 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  37.66 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  35.84 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  36.07 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  34.77 
 
 
424 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  34.77 
 
 
420 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.07 
 
 
402 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.84 
 
 
404 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.91 
 
 
402 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  39.02 
 
 
453 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  36.39 
 
 
421 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  35.61 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  35.12 
 
 
463 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34.95 
 
 
401 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  35.68 
 
 
463 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  42.61 
 
 
439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  36.46 
 
 
424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  37.94 
 
 
433 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  35.9 
 
 
401 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  36.71 
 
 
420 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.74 
 
 
419 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.9 
 
 
409 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  34.74 
 
 
406 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  33.91 
 
 
419 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  36.14 
 
 
403 aa  262  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  40.06 
 
 
407 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  34.49 
 
 
406 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  35.34 
 
 
409 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  37.38 
 
 
409 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  38.36 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.36 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  35.16 
 
 
406 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  36.23 
 
 
422 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  34.8 
 
 
404 aa  258  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.75 
 
 
419 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  36.23 
 
 
423 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  36.05 
 
 
401 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  36.29 
 
 
419 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08221  Type II secretory pathway, component PulF  42.17 
 
 
385 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.373035  hitchhiker  0.0000586534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  36.41 
 
 
405 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  34.99 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  35.14 
 
 
403 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  35.41 
 
 
408 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.82 
 
 
405 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>