More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0327 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 403 aa  788    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  77.67 
 
 		 403 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  61.79 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  54.84 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  54.84 
 
 		 400 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  52.85 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  40.73 
 
 		 409 aa  298  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  42.86 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  42.86 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  39.01 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  39.01 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  39.01 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  39.01 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  38.52 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  39.26 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  38.77 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  38.52 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  36.79 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  38.33 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  37.19 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  37.53 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  36.05 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  35.8 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  40 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  39.41 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  35.89 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  36.59 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  37.44 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  37.93 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  38.27 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  37.93 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  37.93 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  36.01 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  38.02 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  37.04 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  37.53 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  36.27 
 
 		 408 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  34.12 
 
 		 412 aa  259  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  37.87 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  37.96 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  36.61 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  37.87 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  34.9 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  35.63 
 
 		 408 aa  255  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  38.78 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  35.4 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  32.83 
 
 		 401 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1331  general secretion pathway protein F  35.85 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  37.78 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  36.61 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  36.23 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  34.47 
 
 		 406 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  36.03 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  33.25 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  36.67 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  36.36 
 
 		 407 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 419 aa  242  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.75 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  32.59 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  32.09 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  37.1 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  37.25 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  35.13 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  35.28 
 
 		 411 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  32.09 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  36.59 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32.25 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  36.32 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  34 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  33.67 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  34.33 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>