More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  100 
 
 
401 aa  806    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  42.96 
 
 
403 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  39.8 
 
 
406 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  40.45 
 
 
405 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  40.3 
 
 
405 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  39.45 
 
 
405 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  40.1 
 
 
407 aa  325  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  41.9 
 
 
417 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  39.5 
 
 
405 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  41.65 
 
 
417 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.15 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  38.04 
 
 
404 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  39.95 
 
 
405 aa  319  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  37.56 
 
 
409 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  39.85 
 
 
401 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  40.7 
 
 
401 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  41.15 
 
 
417 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  38.29 
 
 
412 aa  315  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.45 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  38.58 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  41.23 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  38.13 
 
 
417 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  38.13 
 
 
403 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  38.18 
 
 
404 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  38.71 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  38.46 
 
 
404 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  36.04 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  40.35 
 
 
419 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  38.31 
 
 
408 aa  305  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  39.31 
 
 
409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  37.82 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  39.8 
 
 
409 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  38.07 
 
 
408 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  39 
 
 
405 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  38.9 
 
 
403 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  37.87 
 
 
406 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  37.68 
 
 
409 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  39.16 
 
 
409 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.36 
 
 
403 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  41.87 
 
 
409 aa  296  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  36.8 
 
 
405 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  39.41 
 
 
410 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  36.55 
 
 
405 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  37.06 
 
 
463 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  37.06 
 
 
463 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  38.21 
 
 
406 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  37.82 
 
 
408 aa  292  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  38.65 
 
 
403 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  35.28 
 
 
406 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  39.8 
 
 
409 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  39.8 
 
 
409 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  36.46 
 
 
408 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  37.44 
 
 
405 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  39.95 
 
 
401 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  35.52 
 
 
419 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  36.8 
 
 
405 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  36.8 
 
 
405 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  37.93 
 
 
406 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  38.15 
 
 
411 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  39.8 
 
 
404 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  39.8 
 
 
404 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  35.59 
 
 
401 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  36.8 
 
 
409 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  35.86 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  35.53 
 
 
419 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  37.56 
 
 
407 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  38.61 
 
 
416 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  36.8 
 
 
407 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  36.55 
 
 
424 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  35.53 
 
 
421 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  36.46 
 
 
405 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  39.34 
 
 
403 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  36.27 
 
 
407 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  35.73 
 
 
412 aa  279  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  35.61 
 
 
401 aa  279  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.29 
 
 
404 aa  278  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  38.18 
 
 
404 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.18 
 
 
405 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  36.55 
 
 
405 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  35.8 
 
 
422 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  36.8 
 
 
405 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  35.28 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  33.25 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  35.28 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  35.03 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  39.2 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  33.67 
 
 
405 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  37.03 
 
 
402 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  34.77 
 
 
406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  34.77 
 
 
406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  35.89 
 
 
405 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  34.61 
 
 
406 aa  272  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  36.48 
 
 
409 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  35.51 
 
 
419 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  34.95 
 
 
407 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  35.53 
 
 
405 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  34 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  34.26 
 
 
405 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2185  Type II secretion system F domain protein  36 
 
 
403 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.170941  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  36.55 
 
 
433 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>