More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0970 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  100 
 
 
417 aa  822    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  44.64 
 
 
402 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  41.83 
 
 
406 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  42.57 
 
 
405 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  44.03 
 
 
401 aa  343  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  40.44 
 
 
405 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  44.78 
 
 
409 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.01 
 
 
405 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  40.81 
 
 
405 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  41.21 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  39.41 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  41.23 
 
 
407 aa  325  9e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  40.54 
 
 
405 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  47.13 
 
 
433 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  38.14 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  38.32 
 
 
401 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  40.69 
 
 
408 aa  319  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  38.19 
 
 
401 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  38.39 
 
 
417 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  37.87 
 
 
405 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  40.74 
 
 
406 aa  316  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  36.11 
 
 
403 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  38.05 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  38.29 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  44.58 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  40 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  40 
 
 
403 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  38.73 
 
 
402 aa  309  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  40.2 
 
 
406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  39.75 
 
 
410 aa  309  6.999999999999999e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  38 
 
 
404 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  38.61 
 
 
408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  41.98 
 
 
409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  38.5 
 
 
407 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  40 
 
 
403 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  37.34 
 
 
405 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  37.09 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  39.85 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  38.32 
 
 
409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  38 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  41.56 
 
 
407 aa  303  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  41.25 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  36.92 
 
 
424 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  38.02 
 
 
424 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  37.12 
 
 
420 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  40.35 
 
 
407 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  39.45 
 
 
409 aa  300  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  39.14 
 
 
404 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  40.35 
 
 
406 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  41.04 
 
 
402 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  39.5 
 
 
409 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  37.31 
 
 
401 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  35.61 
 
 
421 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  37.69 
 
 
405 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  43.58 
 
 
403 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  38.21 
 
 
403 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  41.23 
 
 
410 aa  296  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  39.36 
 
 
416 aa  296  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  38.1 
 
 
405 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  38.83 
 
 
408 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  38.85 
 
 
411 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  38.96 
 
 
407 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  38.33 
 
 
417 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  38.1 
 
 
408 aa  292  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  38.29 
 
 
412 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  37.19 
 
 
421 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  35.25 
 
 
401 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  39.51 
 
 
409 aa  290  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  37.56 
 
 
408 aa  289  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  37.06 
 
 
405 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  37.63 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  37.63 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  34.34 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  38.28 
 
 
422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  36 
 
 
406 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.11 
 
 
419 aa  282  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  36.87 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  39.8 
 
 
404 aa  282  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  38.32 
 
 
409 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  36.63 
 
 
412 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.55 
 
 
405 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  38.4 
 
 
409 aa  279  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  38.5 
 
 
403 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  36.25 
 
 
405 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  35.95 
 
 
419 aa  276  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2903  type II secretion system protein  36.05 
 
 
405 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  39.23 
 
 
407 aa  275  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  36.78 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  40.94 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  36.58 
 
 
404 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  37.22 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  37.16 
 
 
406 aa  273  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  36.3 
 
 
419 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  35.25 
 
 
419 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  36.25 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  35.75 
 
 
417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  39 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  34.24 
 
 
463 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  33.92 
 
 
463 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  39.86 
 
 
439 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>